国库局负责出售这笔资金的两名青年工作人员，给傅斯年寄去几页账本。这时候傅斯年很有政治经验，也谙熟斗争策略。
第一，收集人证物证。第二，耐心等待时机。
1945年7月，在国民参政会四届一次大会上，傅斯年领衔提案，21名参政员联署，题为《彻查中央银行、中央信托局历年积弊，严加整顿，惩罚罪人，以重国家之要务而肃官常案》，要求彻查、改组、追责。
傅斯年一阵炮轰，震惊朝野。
蒋介石坐不住了，邀请傅斯年吃饭，想替孔说情。于是便有了著名的蒋傅对答。
蒋问：“孟真先生，信任我吗？”
傅答：“绝对信任。”
这时候的傅斯年还很懂斗争策略，他的这个回答很得蒋介石欢心。
蒋说：“你既然信也该信任我所用的人。”
傅正色道：“委员长我是信任的，至于说因为信任你，也该信任你所任用的人，那么，砍掉我的脑袋，我也不能这样说！”
老蒋虽然护短，还是欣赏傅斯年的公心和正直，也有雅量听他的逆耳诤言。于是派财政部次长俞鸿钧等人去核查，一查一个准。
1944年11月，孔祥熙免兼财政部长。1945年5月，孔祥熙再丢行政院副院长职务。1945年7月25日，孔祥熙被免去中央银行总裁、四行联合办事处副主.席职务。
抗战胜利后的国民经济每况愈下。在1945年接替孔祥熙担任行政院长的宋子文推出了错误政策，而其小集团惊人腐败，被认为是造成经济衰退的罪人。
1947年，傅斯年对宋子文的行为忍无可忍，在“黄金危机”发生后，他立即发表了《这个样子的宋子文非走开不可》、《宋子文的失败》、《论豪门资本之必须铲除》。这三篇文章引起轰动。朝野震动，宋子文也只好在社会上的一片反对声中辞职。
参政会是具有代议性质的民意机关，参政员有权对政府各级官员提出质询。
傅斯年除了针对孔祥熙展开不妥协的战斗外，对其他的违法乱纪的官员和家属，也不放过。在这其中，傅斯年抨击尤烈的是财政人员的风纪。
如，财政部次长徐堪夫人使用外交护照，携带行李数十件经过美国旧金山时，因发现若干过于贵重的物件，和海关发生争执。